Es ist unklar warum diese Geister existieren. Einer Theorie zurfolge sind es gefallene Chozo, die selbst nach ihrem Tod ihren Planeten verteidigen. Durch die Phazon-Strahlung werden sie sehr aggressiv und greifen alles an, was ihren heiligen Böden zu nahe kommt. Doch ist es fragwürdig, wie Phazon auf diese Geister überhaupt übergreifen konnte.
Chozo Geister ändern permanent ihre Präsenz und sind deshalb sehr gut mit dem X-Ray Visor zu erfassen. Waffensysteme die auf Elektro, Feuer oder Eis basieren, sind nutzlos gegen sie.
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